Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RFTN2Q52LD8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms