Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NBPF1Q3BBV0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms