Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
EDRF1Q3B7T1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms