Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTL8BQ17RB0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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