Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM187BQ17R55 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms