Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1FQ16864 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1FQ16864 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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