Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPROQ16827 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
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