Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
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FOXD1Q16676 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
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FOXD1Q16676 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
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FOXD1Q16676 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
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FOXD1Q16676 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
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FOXD1Q16676 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
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FOXD1Q16676 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
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FOXD1Q16676 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
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FOXD1Q16676 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FOXD1Q16676 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
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