Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
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