Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF239Q16600 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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