Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
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