Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
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