Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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