Protein–RNA interactions for Protein: Q16134

ETFDH, Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFDHQ16134 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ETFDHQ16134 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ETFDHQ16134 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ETFDHQ16134 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ETFDHQ16134 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ETFDHQ16134 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ETFDHQ16134 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ETFDHQ16134 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ETFDHQ16134 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ETFDHQ16134 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ETFDHQ16134 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ETFDHQ16134 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ETFDHQ16134 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ETFDHQ16134 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ETFDHQ16134 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ETFDHQ16134 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ETFDHQ16134 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ETFDHQ16134 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms