Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC85BQ15834 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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