Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA6Q15825 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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