Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms