Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SIX1Q15475 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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