Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNN3Q15417 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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