Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
UBE3CQ15386 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE3CQ15386 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
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