Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
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RABEP1Q15276 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
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RABEP1Q15276 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RABEP1Q15276 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RABEP1Q15276 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RABEP1Q15276 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RABEP1Q15276 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RABEP1Q15276 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RABEP1Q15276 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RABEP1Q15276 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RABEP1Q15276 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RABEP1Q15276 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RABEP1Q15276 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RABEP1Q15276 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RABEP1Q15276 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RABEP1Q15276 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RABEP1Q15276 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RABEP1Q15276 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RABEP1Q15276 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RABEP1Q15276 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RABEP1Q15276 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RABEP1Q15276 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RABEP1Q15276 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RABEP1Q15276 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RABEP1Q15276 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RABEP1Q15276 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RABEP1Q15276 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RABEP1Q15276 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RABEP1Q15276 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
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