Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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BRD3Q15059 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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BRD3Q15059 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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BRD3Q15059 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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BRD3Q15059 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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BRD3Q15059 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRD3Q15059 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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