Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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