Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCAPHQ15003 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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