Protein–RNA interactions for Protein: Q14CS0

UBXN2B, UBX domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2BQ14CS0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN2BQ14CS0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN2BQ14CS0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN2BQ14CS0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN2BQ14CS0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN2BQ14CS0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN2BQ14CS0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN2BQ14CS0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN2BQ14CS0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN2BQ14CS0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN2BQ14CS0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN2BQ14CS0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN2BQ14CS0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN2BQ14CS0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN2BQ14CS0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN2BQ14CS0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN2BQ14CS0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN2BQ14CS0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN2BQ14CS0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN2BQ14CS0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN2BQ14CS0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN2BQ14CS0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN2BQ14CS0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN2BQ14CS0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN2BQ14CS0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN2BQ14CS0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN2BQ14CS0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN2BQ14CS0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN2BQ14CS0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN2BQ14CS0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN2BQ14CS0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN2BQ14CS0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN2BQ14CS0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN2BQ14CS0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN2BQ14CS0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN2BQ14CS0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN2BQ14CS0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN2BQ14CS0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN2BQ14CS0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN2BQ14CS0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN2BQ14CS0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN2BQ14CS0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBXN2BQ14CS0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBXN2BQ14CS0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBXN2BQ14CS0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBXN2BQ14CS0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBXN2BQ14CS0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
UBXN2BQ14CS0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
UBXN2BQ14CS0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBXN2BQ14CS0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBXN2BQ14CS0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBXN2BQ14CS0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBXN2BQ14CS0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBXN2BQ14CS0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBXN2BQ14CS0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBXN2BQ14CS0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBXN2BQ14CS0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBXN2BQ14CS0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN2BQ14CS0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN2BQ14CS0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN2BQ14CS0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN2BQ14CS0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN2BQ14CS0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN2BQ14CS0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN2BQ14CS0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN2BQ14CS0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN2BQ14CS0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN2BQ14CS0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN2BQ14CS0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN2BQ14CS0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN2BQ14CS0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN2BQ14CS0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN2BQ14CS0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN2BQ14CS0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN2BQ14CS0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN2BQ14CS0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN2BQ14CS0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN2BQ14CS0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN2BQ14CS0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN2BQ14CS0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN2BQ14CS0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN2BQ14CS0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN2BQ14CS0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN2BQ14CS0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN2BQ14CS0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN2BQ14CS0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN2BQ14CS0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN2BQ14CS0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN2BQ14CS0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN2BQ14CS0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN2BQ14CS0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN2BQ14CS0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN2BQ14CS0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN2BQ14CS0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN2BQ14CS0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN2BQ14CS0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN2BQ14CS0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN2BQ14CS0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN2BQ14CS0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN2BQ14CS0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms