Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SHPRHQ149N8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
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