Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms