Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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SCARB2Q14108 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARB2Q14108 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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