Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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