Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
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