Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH18Q13634 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
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