Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRQ13535 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRQ13535 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRQ13535 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRQ13535 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRQ13535 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRQ13535 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRQ13535 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRQ13535 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRQ13535 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRQ13535 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRQ13535 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRQ13535 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRQ13535 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRQ13535 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRQ13535 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRQ13535 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRQ13535 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRQ13535 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRQ13535 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRQ13535 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRQ13535 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRQ13535 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRQ13535 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRQ13535 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRQ13535 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRQ13535 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRQ13535 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRQ13535 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRQ13535 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRQ13535 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRQ13535 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRQ13535 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRQ13535 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRQ13535 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRQ13535 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRQ13535 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRQ13535 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRQ13535 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRQ13535 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRQ13535 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRQ13535 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRQ13535 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRQ13535 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRQ13535 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRQ13535 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRQ13535 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRQ13535 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRQ13535 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRQ13535 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRQ13535 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRQ13535 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRQ13535 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRQ13535 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRQ13535 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRQ13535 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRQ13535 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRQ13535 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRQ13535 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRQ13535 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRQ13535 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRQ13535 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRQ13535 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRQ13535 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRQ13535 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRQ13535 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRQ13535 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRQ13535 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRQ13535 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRQ13535 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRQ13535 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRQ13535 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRQ13535 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRQ13535 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRQ13535 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRQ13535 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRQ13535 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRQ13535 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRQ13535 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRQ13535 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRQ13535 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRQ13535 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRQ13535 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRQ13535 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRQ13535 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRQ13535 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRQ13535 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRQ13535 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRQ13535 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRQ13535 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRQ13535 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRQ13535 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRQ13535 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRQ13535 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRQ13535 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATRQ13535 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATRQ13535 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATRQ13535 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
ATRQ13535 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATRQ13535 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
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