Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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