Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SGCGQ13326 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SGCGQ13326 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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