Protein–RNA interactions for Protein: Q13217

DNAJC3, DnaJ homolog subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC3Q13217 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DNAJC3Q13217 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DNAJC3Q13217 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DNAJC3Q13217 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DNAJC3Q13217 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DNAJC3Q13217 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DNAJC3Q13217 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DNAJC3Q13217 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DNAJC3Q13217 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DNAJC3Q13217 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DNAJC3Q13217 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DNAJC3Q13217 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DNAJC3Q13217 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DNAJC3Q13217 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DNAJC3Q13217 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DNAJC3Q13217 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DNAJC3Q13217 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DNAJC3Q13217 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DNAJC3Q13217 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms