Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRPL28Q13084 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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