Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX10Q12887 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX10Q12887 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX10Q12887 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
COX10Q12887 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX10Q12887 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
COX10Q12887 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX10Q12887 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX10Q12887 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX10Q12887 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX10Q12887 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX10Q12887 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX10Q12887 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX10Q12887 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX10Q12887 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX10Q12887 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX10Q12887 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX10Q12887 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX10Q12887 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COX10Q12887 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COX10Q12887 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COX10Q12887 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COX10Q12887 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COX10Q12887 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COX10Q12887 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COX10Q12887 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COX10Q12887 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COX10Q12887 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COX10Q12887 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COX10Q12887 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
COX10Q12887 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COX10Q12887 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
COX10Q12887 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COX10Q12887 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
COX10Q12887 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX10Q12887 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX10Q12887 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX10Q12887 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX10Q12887 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX10Q12887 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX10Q12887 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX10Q12887 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX10Q12887 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX10Q12887 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX10Q12887 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX10Q12887 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX10Q12887 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX10Q12887 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX10Q12887 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX10Q12887 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX10Q12887 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX10Q12887 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX10Q12887 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX10Q12887 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX10Q12887 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COX10Q12887 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX10Q12887 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COX10Q12887 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX10Q12887 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX10Q12887 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX10Q12887 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX10Q12887 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX10Q12887 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX10Q12887 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX10Q12887 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COX10Q12887 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COX10Q12887 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COX10Q12887 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COX10Q12887 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COX10Q12887 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COX10Q12887 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COX10Q12887 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COX10Q12887 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COX10Q12887 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
COX10Q12887 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
COX10Q12887 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COX10Q12887 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COX10Q12887 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COX10Q12887 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COX10Q12887 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COX10Q12887 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COX10Q12887 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COX10Q12887 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COX10Q12887 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COX10Q12887 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COX10Q12887 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
COX10Q12887 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.53
COX10Q12887 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
COX10Q12887 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
COX10Q12887 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COX10Q12887 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COX10Q12887 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
COX10Q12887 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
COX10Q12887 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COX10Q12887 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COX10Q12887 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COX10Q12887 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COX10Q12887 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COX10Q12887 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COX10Q12887 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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