Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C1Q12789 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C1Q12789 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C1Q12789 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C1Q12789 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C1Q12789 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF3C1Q12789 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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GTF3C1Q12789 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF3C1Q12789 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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GTF3C1Q12789 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF3C1Q12789 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF3C1Q12789 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF3C1Q12789 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF3C1Q12789 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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GTF3C1Q12789 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF3C1Q12789 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF3C1Q12789 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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GTF3C1Q12789 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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GTF3C1Q12789 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF3C1Q12789 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF3C1Q12789 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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GTF3C1Q12789 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF3C1Q12789 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF3C1Q12789 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF3C1Q12789 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF3C1Q12789 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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GTF3C1Q12789 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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GTF3C1Q12789 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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GTF3C1Q12789 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GTF3C1Q12789 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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