Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
ARHGEF5Q12774 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ARHGEF5Q12774 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
ARHGEF5Q12774 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARHGEF5Q12774 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARHGEF5Q12774 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
ARHGEF5Q12774 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARHGEF5Q12774 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARHGEF5Q12774 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARHGEF5Q12774 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARHGEF5Q12774 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARHGEF5Q12774 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARHGEF5Q12774 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARHGEF5Q12774 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARHGEF5Q12774 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARHGEF5Q12774 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARHGEF5Q12774 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARHGEF5Q12774 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
ARHGEF5Q12774 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARHGEF5Q12774 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARHGEF5Q12774 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARHGEF5Q12774 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ARHGEF5Q12774 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms