Protein–RNA interactions for Protein: Q12500

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9, yeastyeast

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Length 764 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVL9Q12500 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt1.12□□□□□ -2.23
AVL9Q12500 BEM2YER155C 6504 nt1.11□□□□□ -2.23
AVL9Q12500 GEA2YEL022W 4380 nt1.11□□□□□ -2.23
AVL9Q12500 SMC1YFL008W 3678 nt1.11□□□□□ -2.23
AVL9Q12500 YGR069WYGR069W 336 nt1.1□□□□□ -2.23
AVL9Q12500 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.1□□□□□ -2.23
AVL9Q12500 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.1□□□□□ -2.23
AVL9Q12500 IES4YOR189W 351 nt1.1□□□□□ -2.23
AVL9Q12500 VAM6YDL077C 3150 nt1.1□□□□□ -2.23
AVL9Q12500 MCM10YIL150C 1716 nt1.09□□□□□ -2.23
AVL9Q12500 YOR015WYOR015W 360 nt1.09□□□□□ -2.23
AVL9Q12500 SGF11YPL047W 300 nt1.09□□□□□ -2.23
AVL9Q12500 BUD3YCL014W 4911 nt1.09□□□□□ -2.23
AVL9Q12500 KAP120YPL125W 3099 nt1.08□□□□□ -2.24
AVL9Q12500 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt1.08□□□□□ -2.24
AVL9Q12500 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt1.08□□□□□ -2.24
AVL9Q12500 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt1.07□□□□□ -2.24
AVL9Q12500 CMC4YMR194C-B 222 nt1.06□□□□□ -2.24
AVL9Q12500 NOP9YJL010C 2001 nt1.06□□□□□ -2.24
AVL9Q12500 SCC2YDR180W 4482 nt1.06□□□□□ -2.24
AVL9Q12500 YDL196WYDL196W 330 nt1.05□□□□□ -2.24
AVL9Q12500 YNL211CYNL211C 261 nt1.05□□□□□ -2.24
AVL9Q12500 DOP1YDR141C 5097 nt1.05□□□□□ -2.24
AVL9Q12500 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt1.04□□□□□ -2.24
AVL9Q12500 ISD11YER048W-A 285 nt1.04□□□□□ -2.24
AVL9Q12500 YPL044CYPL044C 549 nt1.04□□□□□ -2.24
AVL9Q12500 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt1.03□□□□□ -2.24
AVL9Q12500 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt1.03□□□□□ -2.24
AVL9Q12500 PAA1YDR071C 576 nt1.02□□□□□ -2.25
AVL9Q12500 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt1.02□□□□□ -2.25
AVL9Q12500 YGL052WYGL052W 306 nt1.02□□□□□ -2.25
AVL9Q12500 YER181CYER181C 324 nt1.01□□□□□ -2.25
AVL9Q12500 YOR282WYOR282W 321 nt1□□□□□ -2.25
AVL9Q12500 ASE1YOR058C 2658 nt1□□□□□ -2.25
AVL9Q12500 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.99□□□□□ -2.25
AVL9Q12500 YPR092WYPR092W 306 nt0.99□□□□□ -2.25
AVL9Q12500 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.98□□□□□ -2.25
AVL9Q12500 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.98□□□□□ -2.25
AVL9Q12500 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt0.98□□□□□ -2.25
AVL9Q12500 BFR2YDR299W 1605 nt0.97□□□□□ -2.25
AVL9Q12500 PMP1YCR024C-A 123 nt0.96□□□□□ -2.26
AVL9Q12500 YDL073WYDL073W 2955 nt0.96□□□□□ -2.26
AVL9Q12500 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.96□□□□□ -2.26
AVL9Q12500 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.96□□□□□ -2.26
AVL9Q12500 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.96□□□□□ -2.26
AVL9Q12500 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.96□□□□□ -2.26
AVL9Q12500 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.96□□□□□ -2.26
AVL9Q12500 RPL26BYGR034W 384 nt0.96□□□□□ -2.26
AVL9Q12500 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt0.96□□□□□ -2.26
AVL9Q12500 snR74snR74 88 nt0.95□□□□□ -2.26
AVL9Q12500 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt0.95□□□□□ -2.26
AVL9Q12500 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.94□□□□□ -2.26
AVL9Q12500 PAU24YBR301W 363 nt0.94□□□□□ -2.26
AVL9Q12500 PRP16YKR086W 3216 nt0.92□□□□□ -2.26
AVL9Q12500 YML099W-AYML099W-A 330 nt0.92□□□□□ -2.26
AVL9Q12500 snR49snR49 165 nt0.92□□□□□ -2.26
AVL9Q12500 RKR1YMR247C 4689 nt0.91□□□□□ -2.26
AVL9Q12500 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.9□□□□□ -2.27
AVL9Q12500 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.9□□□□□ -2.27
AVL9Q12500 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt0.87□□□□□ -2.27
AVL9Q12500 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.87□□□□□ -2.27
AVL9Q12500 snR190snR190 190 nt0.87□□□□□ -2.27
AVL9Q12500 SEC8YPR055W 3198 nt0.87□□□□□ -2.27
AVL9Q12500 snR55snR55 98 nt0.86□□□□□ -2.27
AVL9Q12500 NPR2YEL062W 1848 nt0.85□□□□□ -2.27
AVL9Q12500 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt0.85□□□□□ -2.27
AVL9Q12500 COY1YKL179C 2040 nt0.85□□□□□ -2.27
AVL9Q12500 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.85□□□□□ -2.27
AVL9Q12500 UBP3YER151C 2739 nt0.84□□□□□ -2.27
AVL9Q12500 YLR282CYLR282C 342 nt0.84□□□□□ -2.27
AVL9Q12500 CHS6YJL099W 2241 nt0.83□□□□□ -2.28
AVL9Q12500 YCR022CYCR022C 345 nt0.83□□□□□ -2.28
AVL9Q12500 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt0.83□□□□□ -2.28
AVL9Q12500 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt0.82□□□□□ -2.28
AVL9Q12500 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.82□□□□□ -2.28
AVL9Q12500 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.82□□□□□ -2.28
AVL9Q12500 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt0.82□□□□□ -2.28
AVL9Q12500 YKU70YMR284W 1809 nt0.82□□□□□ -2.28
AVL9Q12500 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.81□□□□□ -2.28
AVL9Q12500 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.81□□□□□ -2.28
AVL9Q12500 RPS30BYOR182C 192 nt0.81□□□□□ -2.28
AVL9Q12500 YGL041CYGL041C 204 nt0.8□□□□□ -2.28
AVL9Q12500 BLI1YKL061W 342 nt0.8□□□□□ -2.28
AVL9Q12500 ABF2YMR072W 552 nt0.8□□□□□ -2.28
AVL9Q12500 HAL9YOL089C 3093 nt0.8□□□□□ -2.28
AVL9Q12500 FYV10YIL097W 1551 nt0.79□□□□□ -2.28
AVL9Q12500 PRP5YBR237W 2550 nt0.79□□□□□ -2.28
AVL9Q12500 COX5BYIL111W 456 nt0.79□□□□□ -2.28
AVL9Q12500 COX12YLR038C 252 nt0.79□□□□□ -2.28
AVL9Q12500 LTE1YAL024C 4308 nt0.78□□□□□ -2.28
AVL9Q12500 SEC1YDR164C 2175 nt0.77□□□□□ -2.29
AVL9Q12500 YML002WYML002W 2214 nt0.77□□□□□ -2.29
AVL9Q12500 ULI1YFR026C 510 nt0.77□□□□□ -2.29
AVL9Q12500 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.77□□□□□ -2.29
AVL9Q12500 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.77□□□□□ -2.29
AVL9Q12500 YOR345CYOR345C 351 nt0.76□□□□□ -2.29
AVL9Q12500 snR8snR8 190 nt0.75□□□□□ -2.29
AVL9Q12500 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.75□□□□□ -2.29
AVL9Q12500 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.75□□□□□ -2.29
AVL9Q12500 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.75□□□□□ -2.29
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