Protein–RNA interactions for Protein: Q12408

NPC2, Phosphatidylglycerol/phosphatidylinositol transfer protein, yeastyeast

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NPC2Q12408 LHS1YKL073W 2646 nt1.88□□□□□ -2.11
NPC2Q12408 SPP41YDR464W 4308 nt1.88□□□□□ -2.11
NPC2Q12408 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt1.88□□□□□ -2.11
NPC2Q12408 YLR282CYLR282C 342 nt1.88□□□□□ -2.11
NPC2Q12408 SPO24YPR036W-A 204 nt1.88□□□□□ -2.11
NPC2Q12408 CSF1YLR087C 8877 nt1.87□□□□□ -2.11
NPC2Q12408 UFD4YKL010C 4452 nt1.87□□□□□ -2.11
NPC2Q12408 SEC63YOR254C 1992 nt1.87□□□□□ -2.11
NPC2Q12408 TRM3YDL112W 4311 nt1.86□□□□□ -2.11
NPC2Q12408 SOM1YEL059C-A 225 nt1.86□□□□□ -2.11
NPC2Q12408 YER172C-AYER172C-A 381 nt1.86□□□□□ -2.11
NPC2Q12408 YGL182CYGL182C 324 nt1.86□□□□□ -2.11
NPC2Q12408 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt1.86□□□□□ -2.11
NPC2Q12408 UTP21YLR409C 2820 nt1.85□□□□□ -2.11
NPC2Q12408 UFD2YDL190C 2886 nt1.85□□□□□ -2.11
NPC2Q12408 HER1YOR227W 3741 nt1.85□□□□□ -2.11
NPC2Q12408 TDA9YML081W 3756 nt1.85□□□□□ -2.11
NPC2Q12408 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt1.85□□□□□ -2.11
NPC2Q12408 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt1.85□□□□□ -2.11
NPC2Q12408 MSH6YDR097C 3729 nt1.85□□□□□ -2.11
NPC2Q12408 GCN2YDR283C 4980 nt1.85□□□□□ -2.11
NPC2Q12408 POL5YEL055C 3069 nt1.85□□□□□ -2.11
NPC2Q12408 USO1YDL058W 5373 nt1.84□□□□□ -2.11
NPC2Q12408 UTP8YGR128C 2142 nt1.84□□□□□ -2.11
NPC2Q12408 SBH1YER087C-B 249 nt1.84□□□□□ -2.11
NPC2Q12408 NUT1YGL151W 3399 nt1.84□□□□□ -2.11
NPC2Q12408 BFR2YDR299W 1605 nt1.84□□□□□ -2.12
NPC2Q12408 YLL020CYLL020C 306 nt1.83□□□□□ -2.12
NPC2Q12408 COA6YMR244C-A 315 nt1.83□□□□□ -2.12
NPC2Q12408 MYO4YAL029C 4416 nt1.82□□□□□ -2.12
NPC2Q12408 BPH1YCR032W 6504 nt1.82□□□□□ -2.12
NPC2Q12408 STB6YKL072W 2301 nt1.82□□□□□ -2.12
NPC2Q12408 RAD50YNL250W 3939 nt1.8□□□□□ -2.12
NPC2Q12408 RSM22YKL155C 1887 nt1.8□□□□□ -2.12
NPC2Q12408 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt1.8□□□□□ -2.12
NPC2Q12408 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt1.8□□□□□ -2.12
NPC2Q12408 YJR039WYJR039W 3366 nt1.8□□□□□ -2.12
NPC2Q12408 ALY2YJL084C 3141 nt1.8□□□□□ -2.12
NPC2Q12408 GYP5YPL249C 2685 nt1.79□□□□□ -2.12
NPC2Q12408 QCR9YGR183C 201 nt1.79□□□□□ -2.12
NPC2Q12408 EMC5YIL027C 426 nt1.79□□□□□ -2.12
NPC2Q12408 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt1.79□□□□□ -2.12
NPC2Q12408 YLR419WYLR419W 4308 nt1.78□□□□□ -2.12
NPC2Q12408 PAN2YGL094C 3348 nt1.78□□□□□ -2.12
NPC2Q12408 STF2YGR008C 255 nt1.78□□□□□ -2.12
NPC2Q12408 YOR093CYOR093C 4947 nt1.77□□□□□ -2.13
NPC2Q12408 INO80YGL150C 4470 nt1.77□□□□□ -2.13
NPC2Q12408 TBS1YBR150C 3285 nt1.77□□□□□ -2.13
NPC2Q12408 MYO2YOR326W 4725 nt1.77□□□□□ -2.13
NPC2Q12408 SIR4YDR227W 4077 nt1.76□□□□□ -2.13
NPC2Q12408 MMS4YBR098W 2076 nt1.76□□□□□ -2.13
NPC2Q12408 FKS1YLR342W 5631 nt1.76□□□□□ -2.13
NPC2Q12408 EAF1YDR359C 2949 nt1.76□□□□□ -2.13
NPC2Q12408 COX5BYIL111W 456 nt1.76□□□□□ -2.13
NPC2Q12408 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt1.75□□□□□ -2.13
NPC2Q12408 snR39BsnR39B 96 nt1.75□□□□□ -2.13
NPC2Q12408 SLX4YLR135W 2247 nt1.74□□□□□ -2.13
NPC2Q12408 KIP1YBL063W 3336 nt1.74□□□□□ -2.13
NPC2Q12408 YAR009CYAR009C 3591 nt1.74□□□□□ -2.13
NPC2Q12408 TAH1YCR060W 336 nt1.74□□□□□ -2.13
NPC2Q12408 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt1.74□□□□□ -2.13
NPC2Q12408 PDR8YLR266C 2106 nt1.73□□□□□ -2.13
NPC2Q12408 ATG9YDL149W 2994 nt1.72□□□□□ -2.13
NPC2Q12408 NUP157YER105C 4176 nt1.72□□□□□ -2.13
NPC2Q12408 SMC1YFL008W 3678 nt1.72□□□□□ -2.13
NPC2Q12408 UBP2YOR124C 3819 nt1.72□□□□□ -2.13
NPC2Q12408 snR14snR14 160 nt1.71□□□□□ -2.14
NPC2Q12408 SEC31YDL195W 3822 nt1.7□□□□□ -2.14
NPC2Q12408 YML002WYML002W 2214 nt1.7□□□□□ -2.14
NPC2Q12408 SMC4YLR086W 4257 nt1.7□□□□□ -2.14
NPC2Q12408 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.7□□□□□ -2.14
NPC2Q12408 DNF3YMR162C 4971 nt1.69□□□□□ -2.14
NPC2Q12408 FIG2YCR089W 4830 nt1.69□□□□□ -2.14
NPC2Q12408 SKI3YPR189W 4299 nt1.69□□□□□ -2.14
NPC2Q12408 MGA2YIR033W 3342 nt1.68□□□□□ -2.14
NPC2Q12408 RTP1YMR185W 2946 nt1.67□□□□□ -2.14
NPC2Q12408 NEO1YIL048W 3456 nt1.67□□□□□ -2.14
NPC2Q12408 KCS1YDR017C 3153 nt1.66□□□□□ -2.14
NPC2Q12408 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt1.66□□□□□ -2.14
NPC2Q12408 SEC21YNL287W 2808 nt1.66□□□□□ -2.14
NPC2Q12408 RCO1YMR075W 2055 nt1.65□□□□□ -2.14
NPC2Q12408 YLR041WYLR041W 321 nt1.65□□□□□ -2.15
NPC2Q12408 KAP122YGL016W 3246 nt1.64□□□□□ -2.15
NPC2Q12408 NOP9YJL010C 2001 nt1.64□□□□□ -2.15
NPC2Q12408 FYV10YIL097W 1551 nt1.64□□□□□ -2.15
NPC2Q12408 STO1YMR125W 2586 nt1.63□□□□□ -2.15
NPC2Q12408 VPS15YBR097W 4365 nt1.63□□□□□ -2.15
NPC2Q12408 MON2YNL297C 4911 nt1.62□□□□□ -2.15
NPC2Q12408 YCS4YLR272C 3531 nt1.62□□□□□ -2.15
NPC2Q12408 YLR232WYLR232W 348 nt1.62□□□□□ -2.15
NPC2Q12408 SET3YKR029C 2256 nt1.62□□□□□ -2.15
NPC2Q12408 YLR422WYLR422W 5799 nt1.62□□□□□ -2.15
NPC2Q12408 snR190snR190 190 nt1.61□□□□□ -2.15
NPC2Q12408 COG6YNL041C 2520 nt1.61□□□□□ -2.15
NPC2Q12408 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt1.6□□□□□ -2.15
NPC2Q12408 RGA1YOR127W 3024 nt1.6□□□□□ -2.15
NPC2Q12408 WAR1YML076C 2835 nt1.58□□□□□ -2.16
NPC2Q12408 FAB1YFR019W 6837 nt1.57□□□□□ -2.16
NPC2Q12408 YDR210WYDR210W 228 nt1.57□□□□□ -2.16
NPC2Q12408 RPL26BYGR034W 384 nt1.57□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.4 ms