Protein–RNA interactions for Protein: Q12241

VAM3, Syntaxin VAM3, yeastyeast

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VAM3Q12241 CMC4YMR194C-B 222 nt0.95□□□□□ -2.26
VAM3Q12241 YOR282WYOR282W 321 nt0.95□□□□□ -2.26
VAM3Q12241 YPL044CYPL044C 549 nt0.95□□□□□ -2.26
VAM3Q12241 SIP4YJL089W 2490 nt0.94□□□□□ -2.26
VAM3Q12241 PAA1YDR071C 576 nt0.94□□□□□ -2.26
VAM3Q12241 SGF11YPL047W 300 nt0.94□□□□□ -2.26
VAM3Q12241 YNL028WYNL028W 318 nt0.93□□□□□ -2.26
VAM3Q12241 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.92□□□□□ -2.26
VAM3Q12241 YNL211CYNL211C 261 nt0.92□□□□□ -2.26
VAM3Q12241 IML1YJR138W 4755 nt0.92□□□□□ -2.26
VAM3Q12241 SCC2YDR180W 4482 nt0.91□□□□□ -2.26
VAM3Q12241 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.91□□□□□ -2.26
VAM3Q12241 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.91□□□□□ -2.26
VAM3Q12241 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.91□□□□□ -2.26
VAM3Q12241 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.91□□□□□ -2.26
VAM3Q12241 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.91□□□□□ -2.26
VAM3Q12241 IES4YOR189W 351 nt0.91□□□□□ -2.26
VAM3Q12241 BEM2YER155C 6504 nt0.91□□□□□ -2.26
VAM3Q12241 TTI1YKL033W 3117 nt0.91□□□□□ -2.26
VAM3Q12241 BFR2YDR299W 1605 nt0.89□□□□□ -2.27
VAM3Q12241 YDL073WYDL073W 2955 nt0.88□□□□□ -2.27
VAM3Q12241 RPL26BYGR034W 384 nt0.88□□□□□ -2.27
VAM3Q12241 RAD61YDR014W 1944 nt0.87□□□□□ -2.27
VAM3Q12241 PMP1YCR024C-A 123 nt0.87□□□□□ -2.27
VAM3Q12241 YNL146WYNL146W 303 nt0.87□□□□□ -2.27
VAM3Q12241 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.86□□□□□ -2.27
VAM3Q12241 ASE1YOR058C 2658 nt0.86□□□□□ -2.27
VAM3Q12241 snR65snR65 100 nt0.84□□□□□ -2.27
VAM3Q12241 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.84□□□□□ -2.27
VAM3Q12241 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt0.84□□□□□ -2.27
VAM3Q12241 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt0.84□□□□□ -2.27
VAM3Q12241 PRP16YKR086W 3216 nt0.83□□□□□ -2.28
VAM3Q12241 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.83□□□□□ -2.28
VAM3Q12241 YGR069WYGR069W 336 nt0.83□□□□□ -2.28
VAM3Q12241 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.83□□□□□ -2.28
VAM3Q12241 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt0.83□□□□□ -2.28
VAM3Q12241 YOR015WYOR015W 360 nt0.83□□□□□ -2.28
VAM3Q12241 YPR117WYPR117W 7470 nt0.83□□□□□ -2.28
VAM3Q12241 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.82□□□□□ -2.28
VAM3Q12241 RKR1YMR247C 4689 nt0.82□□□□□ -2.28
VAM3Q12241 DOP1YDR141C 5097 nt0.82□□□□□ -2.28
VAM3Q12241 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.8□□□□□ -2.28
VAM3Q12241 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt0.8□□□□□ -2.28
VAM3Q12241 SEC8YPR055W 3198 nt0.79□□□□□ -2.28
VAM3Q12241 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.79□□□□□ -2.28
VAM3Q12241 YGL052WYGL052W 306 nt0.79□□□□□ -2.28
VAM3Q12241 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt0.79□□□□□ -2.28
VAM3Q12241 NPR2YEL062W 1848 nt0.78□□□□□ -2.28
VAM3Q12241 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.78□□□□□ -2.28
VAM3Q12241 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.78□□□□□ -2.28
VAM3Q12241 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt0.78□□□□□ -2.28
VAM3Q12241 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.78□□□□□ -2.28
VAM3Q12241 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt0.78□□□□□ -2.28
VAM3Q12241 YPR092WYPR092W 306 nt0.78□□□□□ -2.28
VAM3Q12241 snR190snR190 190 nt0.77□□□□□ -2.29
VAM3Q12241 CHS6YJL099W 2241 nt0.76□□□□□ -2.29
VAM3Q12241 PAU24YBR301W 363 nt0.76□□□□□ -2.29
VAM3Q12241 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.75□□□□□ -2.29
VAM3Q12241 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.74□□□□□ -2.29
VAM3Q12241 SEC1YDR164C 2175 nt0.74□□□□□ -2.29
VAM3Q12241 UBP3YER151C 2739 nt0.72□□□□□ -2.29
VAM3Q12241 COX5BYIL111W 456 nt0.72□□□□□ -2.29
VAM3Q12241 YLR282CYLR282C 342 nt0.72□□□□□ -2.29
VAM3Q12241 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt0.72□□□□□ -2.29
VAM3Q12241 COY1YKL179C 2040 nt0.72□□□□□ -2.29
VAM3Q12241 HAL9YOL089C 3093 nt0.72□□□□□ -2.29
VAM3Q12241 FYV10YIL097W 1551 nt0.71□□□□□ -2.3
VAM3Q12241 YML002WYML002W 2214 nt0.71□□□□□ -2.3
VAM3Q12241 snR74snR74 88 nt0.71□□□□□ -2.3
VAM3Q12241 PRP5YBR237W 2550 nt0.69□□□□□ -2.3
VAM3Q12241 PAM16YJL104W 450 nt0.69□□□□□ -2.3
VAM3Q12241 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.69□□□□□ -2.3
VAM3Q12241 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.68□□□□□ -2.3
VAM3Q12241 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.68□□□□□ -2.3
VAM3Q12241 LTE1YAL024C 4308 nt0.67□□□□□ -2.3
VAM3Q12241 BLI1YKL061W 342 nt0.67□□□□□ -2.3
VAM3Q12241 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.66□□□□□ -2.3
VAM3Q12241 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt0.66□□□□□ -2.3
VAM3Q12241 snR49snR49 165 nt0.66□□□□□ -2.3
VAM3Q12241 OST4YDL232W 111 nt0.65□□□□□ -2.31
VAM3Q12241 ULI1YFR026C 510 nt0.65□□□□□ -2.31
VAM3Q12241 YER181CYER181C 324 nt0.64□□□□□ -2.31
VAM3Q12241 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt0.64□□□□□ -2.31
VAM3Q12241 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.64□□□□□ -2.31
VAM3Q12241 PRP42YDR235W 1635 nt0.64□□□□□ -2.31
VAM3Q12241 snR55snR55 98 nt0.63□□□□□ -2.31
VAM3Q12241 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt0.63□□□□□ -2.31
VAM3Q12241 COX12YLR038C 252 nt0.63□□□□□ -2.31
VAM3Q12241 RPS30BYOR182C 192 nt0.63□□□□□ -2.31
VAM3Q12241 YCR022CYCR022C 345 nt0.62□□□□□ -2.31
VAM3Q12241 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.62□□□□□ -2.31
VAM3Q12241 BEM3YPL115C 3387 nt0.62□□□□□ -2.31
VAM3Q12241 UTP10YJL109C 5310 nt0.61□□□□□ -2.31
VAM3Q12241 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.61□□□□□ -2.31
VAM3Q12241 YKU70YMR284W 1809 nt0.61□□□□□ -2.31
VAM3Q12241 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.6□□□□□ -2.31
VAM3Q12241 YLR041WYLR041W 321 nt0.6□□□□□ -2.31
VAM3Q12241 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt0.6□□□□□ -2.31
VAM3Q12241 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.59□□□□□ -2.31
VAM3Q12241 YOR345CYOR345C 351 nt0.59□□□□□ -2.31
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