Protein–RNA interactions for Protein: Q12098

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, yeastyeast

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Length 748 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLX4Q12098 CDC36YDL165W 576 nt1.51□□□□□ -2.17
SLX4Q12098 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.51□□□□□ -2.17
SLX4Q12098 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.51□□□□□ -2.17
SLX4Q12098 RSM22YKL155C 1887 nt1.51□□□□□ -2.17
SLX4Q12098 MDS3YGL197W 4464 nt1.48□□□□□ -2.17
SLX4Q12098 EAF1YDR359C 2949 nt1.48□□□□□ -2.17
SLX4Q12098 WAR1YML076C 2835 nt1.48□□□□□ -2.17
SLX4Q12098 SPG3YDR504C 384 nt1.47□□□□□ -2.17
SLX4Q12098 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt1.47□□□□□ -2.17
SLX4Q12098 NPR2YEL062W 1848 nt1.47□□□□□ -2.17
SLX4Q12098 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt1.46□□□□□ -2.18
SLX4Q12098 STB6YKL072W 2301 nt1.46□□□□□ -2.18
SLX4Q12098 MSH3YCR092C 3057 nt1.46□□□□□ -2.18
SLX4Q12098 NUP157YER105C 4176 nt1.45□□□□□ -2.18
SLX4Q12098 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt1.45□□□□□ -2.18
SLX4Q12098 YKU70YMR284W 1809 nt1.45□□□□□ -2.18
SLX4Q12098 OLI1Q0130 231 nt1.44□□□□□ -2.18
SLX4Q12098 LAA1YJL207C 6045 nt1.43□□□□□ -2.18
SLX4Q12098 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt1.43□□□□□ -2.18
SLX4Q12098 CDC39YCR093W 6327 nt1.41□□□□□ -2.18
SLX4Q12098 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.41□□□□□ -2.18
SLX4Q12098 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.41□□□□□ -2.18
SLX4Q12098 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.41□□□□□ -2.18
SLX4Q12098 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.41□□□□□ -2.18
SLX4Q12098 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.41□□□□□ -2.18
SLX4Q12098 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.41□□□□□ -2.18
SLX4Q12098 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.41□□□□□ -2.18
SLX4Q12098 ISD11YER048W-A 285 nt1.4□□□□□ -2.19
SLX4Q12098 JLP2YMR132C 627 nt1.4□□□□□ -2.19
SLX4Q12098 YOR302WYOR302W 78 nt1.4□□□□□ -2.19
SLX4Q12098 GEA2YEL022W 4380 nt1.4□□□□□ -2.19
SLX4Q12098 APL1YJR005W 2103 nt1.4□□□□□ -2.19
SLX4Q12098 YDL196WYDL196W 330 nt1.39□□□□□ -2.19
SLX4Q12098 BLI1YKL061W 342 nt1.39□□□□□ -2.19
SLX4Q12098 YNL211CYNL211C 261 nt1.39□□□□□ -2.19
SLX4Q12098 RAD9YDR217C 3930 nt1.38□□□□□ -2.19
SLX4Q12098 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt1.37□□□□□ -2.19
SLX4Q12098 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt1.37□□□□□ -2.19
SLX4Q12098 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt1.37□□□□□ -2.19
SLX4Q12098 PAA1YDR071C 576 nt1.36□□□□□ -2.19
SLX4Q12098 YGR130CYGR130C 2451 nt1.36□□□□□ -2.19
SLX4Q12098 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.36□□□□□ -2.19
SLX4Q12098 HUG1YML058W-A 207 nt1.36□□□□□ -2.19
SLX4Q12098 CMC4YMR194C-B 222 nt1.36□□□□□ -2.19
SLX4Q12098 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt1.35□□□□□ -2.19
SLX4Q12098 NOP9YJL010C 2001 nt1.34□□□□□ -2.19
SLX4Q12098 ULI1YFR026C 510 nt1.34□□□□□ -2.19
SLX4Q12098 STF2YGR008C 255 nt1.34□□□□□ -2.19
SLX4Q12098 NST1YNL091W 3723 nt1.34□□□□□ -2.2
SLX4Q12098 APQ12YIL040W 417 nt1.33□□□□□ -2.2
SLX4Q12098 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt1.32□□□□□ -2.2
SLX4Q12098 YPL044CYPL044C 549 nt1.32□□□□□ -2.2
SLX4Q12098 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.31□□□□□ -2.2
SLX4Q12098 KAP120YPL125W 3099 nt1.31□□□□□ -2.2
SLX4Q12098 RPL33BYOR234C 324 nt1.31□□□□□ -2.2
SLX4Q12098 YOR345CYOR345C 351 nt1.31□□□□□ -2.2
SLX4Q12098 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt1.3□□□□□ -2.2
SLX4Q12098 TTI1YKL033W 3117 nt1.29□□□□□ -2.2
SLX4Q12098 RPL26BYGR034W 384 nt1.27□□□□□ -2.21
SLX4Q12098 RPS30BYOR182C 192 nt1.27□□□□□ -2.21
SLX4Q12098 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt1.26□□□□□ -2.21
SLX4Q12098 YEL014CYEL014C 306 nt1.26□□□□□ -2.21
SLX4Q12098 PAM16YJL104W 450 nt1.25□□□□□ -2.21
SLX4Q12098 COY1YKL179C 2040 nt1.24□□□□□ -2.21
SLX4Q12098 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt1.24□□□□□ -2.21
SLX4Q12098 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt1.24□□□□□ -2.21
SLX4Q12098 COX12YLR038C 252 nt1.24□□□□□ -2.21
SLX4Q12098 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt1.24□□□□□ -2.21
SLX4Q12098 IML1YJR138W 4755 nt1.23□□□□□ -2.21
SLX4Q12098 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt1.23□□□□□ -2.21
SLX4Q12098 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt1.22□□□□□ -2.21
SLX4Q12098 VAM6YDL077C 3150 nt1.22□□□□□ -2.21
SLX4Q12098 SIP4YJL089W 2490 nt1.21□□□□□ -2.22
SLX4Q12098 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.21□□□□□ -2.22
SLX4Q12098 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.21□□□□□ -2.22
SLX4Q12098 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt1.21□□□□□ -2.22
SLX4Q12098 YLR282CYLR282C 342 nt1.2□□□□□ -2.22
SLX4Q12098 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt1.19□□□□□ -2.22
SLX4Q12098 snR190snR190 190 nt1.19□□□□□ -2.22
SLX4Q12098 SPT7YBR081C 3999 nt1.19□□□□□ -2.22
SLX4Q12098 BUD3YCL014W 4911 nt1.19□□□□□ -2.22
SLX4Q12098 SCC2YDR180W 4482 nt1.18□□□□□ -2.22
SLX4Q12098 PMP1YCR024C-A 123 nt1.18□□□□□ -2.22
SLX4Q12098 COX5BYIL111W 456 nt1.18□□□□□ -2.22
SLX4Q12098 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt1.18□□□□□ -2.22
SLX4Q12098 HAL9YOL089C 3093 nt1.18□□□□□ -2.22
SLX4Q12098 ASE1YOR058C 2658 nt1.17□□□□□ -2.22
SLX4Q12098 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt1.16□□□□□ -2.22
SLX4Q12098 YML002WYML002W 2214 nt1.16□□□□□ -2.22
SLX4Q12098 BFR2YDR299W 1605 nt1.15□□□□□ -2.22
SLX4Q12098 SEC8YPR055W 3198 nt1.15□□□□□ -2.22
SLX4Q12098 BEM2YER155C 6504 nt1.15□□□□□ -2.23
SLX4Q12098 PRP16YKR086W 3216 nt1.14□□□□□ -2.23
SLX4Q12098 YER053C-AYER053C-A 114 nt1.14□□□□□ -2.23
SLX4Q12098 YNL337WYNL337W 255 nt1.14□□□□□ -2.23
SLX4Q12098 snR46snR46 197 nt1.13□□□□□ -2.23
SLX4Q12098 snR52snR52 92 nt1.12□□□□□ -2.23
SLX4Q12098 UTP8YGR128C 2142 nt1.1□□□□□ -2.23
SLX4Q12098 DOP1YDR141C 5097 nt1.1□□□□□ -2.23
SLX4Q12098 YDL073WYDL073W 2955 nt1.1□□□□□ -2.23
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