Protein–RNA interactions for Protein: Q12006

PFA4, Palmitoyltransferase PFA4, yeastyeast

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PFA4Q12006 CDC31YOR257W 486 nt1.49□□□□□ -2.17
PFA4Q12006 PMP1YCR024C-A 123 nt1.48□□□□□ -2.17
PFA4Q12006 YDL206WYDL206W 2289 nt1.48□□□□□ -2.17
PFA4Q12006 PKH3YDR466W 2697 nt1.48□□□□□ -2.17
PFA4Q12006 PAN2YGL094C 3348 nt1.48□□□□□ -2.17
PFA4Q12006 YCS4YLR272C 3531 nt1.48□□□□□ -2.17
PFA4Q12006 MMS4YBR098W 2076 nt1.47□□□□□ -2.17
PFA4Q12006 KCS1YDR017C 3153 nt1.47□□□□□ -2.17
PFA4Q12006 APL1YJR005W 2103 nt1.47□□□□□ -2.17
PFA4Q12006 SLX4YLR135W 2247 nt1.46□□□□□ -2.18
PFA4Q12006 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt1.46□□□□□ -2.18
PFA4Q12006 YNL170WYNL170W 396 nt1.46□□□□□ -2.18
PFA4Q12006 YLL054CYLL054C 2532 nt1.45□□□□□ -2.18
PFA4Q12006 FIG2YCR089W 4830 nt1.45□□□□□ -2.18
PFA4Q12006 VPS15YBR097W 4365 nt1.44□□□□□ -2.18
PFA4Q12006 PAA1YDR071C 576 nt1.44□□□□□ -2.18
PFA4Q12006 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.44□□□□□ -2.18
PFA4Q12006 TTI1YKL033W 3117 nt1.43□□□□□ -2.18
PFA4Q12006 YJL022WYJL022W 309 nt1.43□□□□□ -2.18
PFA4Q12006 COX12YLR038C 252 nt1.43□□□□□ -2.18
PFA4Q12006 RPS30BYOR182C 192 nt1.43□□□□□ -2.18
PFA4Q12006 SMC4YLR086W 4257 nt1.43□□□□□ -2.18
PFA4Q12006 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt1.42□□□□□ -2.18
PFA4Q12006 YNL211CYNL211C 261 nt1.42□□□□□ -2.18
PFA4Q12006 CHS1YNL192W 3396 nt1.41□□□□□ -2.18
PFA4Q12006 YPL044CYPL044C 549 nt1.41□□□□□ -2.18
PFA4Q12006 YLR422WYLR422W 5799 nt1.41□□□□□ -2.18
PFA4Q12006 SAC3YDR159W 3906 nt1.41□□□□□ -2.18
PFA4Q12006 POL5YEL055C 3069 nt1.41□□□□□ -2.18
PFA4Q12006 SDH6YDR379C-A 240 nt1.4□□□□□ -2.19
PFA4Q12006 YGR164WYGR164W 336 nt1.4□□□□□ -2.19
PFA4Q12006 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt1.4□□□□□ -2.19
PFA4Q12006 YAR009CYAR009C 3591 nt1.4□□□□□ -2.19
PFA4Q12006 MDS3YGL197W 4464 nt1.4□□□□□ -2.19
PFA4Q12006 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt1.39□□□□□ -2.19
PFA4Q12006 snR14snR14 160 nt1.39□□□□□ -2.19
PFA4Q12006 RSM22YKL155C 1887 nt1.39□□□□□ -2.19
PFA4Q12006 SNU13YEL026W 381 nt1.38□□□□□ -2.19
PFA4Q12006 SMC1YFL008W 3678 nt1.38□□□□□ -2.19
PFA4Q12006 KAP122YGL016W 3246 nt1.38□□□□□ -2.19
PFA4Q12006 PRP42YDR235W 1635 nt1.37□□□□□ -2.19
PFA4Q12006 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt1.37□□□□□ -2.19
PFA4Q12006 YLR419WYLR419W 4308 nt1.37□□□□□ -2.19
PFA4Q12006 MON2YNL297C 4911 nt1.36□□□□□ -2.19
PFA4Q12006 YOR019WYOR019W 2193 nt1.35□□□□□ -2.19
PFA4Q12006 STO1YMR125W 2586 nt1.34□□□□□ -2.19
PFA4Q12006 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt1.34□□□□□ -2.19
PFA4Q12006 MSH3YCR092C 3057 nt1.34□□□□□ -2.2
PFA4Q12006 BST1YFL025C 3090 nt1.34□□□□□ -2.2
PFA4Q12006 SET3YKR029C 2256 nt1.33□□□□□ -2.2
PFA4Q12006 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt1.33□□□□□ -2.2
PFA4Q12006 EAF1YDR359C 2949 nt1.33□□□□□ -2.2
PFA4Q12006 CCH1YGR217W 6120 nt1.32□□□□□ -2.2
PFA4Q12006 PRP5YBR237W 2550 nt1.32□□□□□ -2.2
PFA4Q12006 LAA1YJL207C 6045 nt1.32□□□□□ -2.2
PFA4Q12006 SWI4YER111C 3282 nt1.32□□□□□ -2.2
PFA4Q12006 CDC25YLR310C 4770 nt1.3□□□□□ -2.2
PFA4Q12006 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.3□□□□□ -2.2
PFA4Q12006 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.3□□□□□ -2.2
PFA4Q12006 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.3□□□□□ -2.2
PFA4Q12006 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.3□□□□□ -2.2
PFA4Q12006 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.3□□□□□ -2.2
PFA4Q12006 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.3□□□□□ -2.2
PFA4Q12006 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.3□□□□□ -2.2
PFA4Q12006 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt1.3□□□□□ -2.2
PFA4Q12006 CMC4YMR194C-B 222 nt1.3□□□□□ -2.2
PFA4Q12006 YOR102WYOR102W 351 nt1.3□□□□□ -2.2
PFA4Q12006 ROM2YLR371W 4071 nt1.3□□□□□ -2.2
PFA4Q12006 SPC110YDR356W 2835 nt1.3□□□□□ -2.2
PFA4Q12006 WAR1YML076C 2835 nt1.3□□□□□ -2.2
PFA4Q12006 NOP9YJL010C 2001 nt1.29□□□□□ -2.2
PFA4Q12006 YER053C-AYER053C-A 114 nt1.29□□□□□ -2.2
PFA4Q12006 YBL053WYBL053W 375 nt1.29□□□□□ -2.2
PFA4Q12006 NUP145YGL092W 3954 nt1.29□□□□□ -2.2
PFA4Q12006 SXM1YDR395W 2835 nt1.29□□□□□ -2.2
PFA4Q12006 APL3YBL037W 3078 nt1.29□□□□□ -2.2
PFA4Q12006 SSK2YNR031C 4740 nt1.28□□□□□ -2.2
PFA4Q12006 UTP8YGR128C 2142 nt1.28□□□□□ -2.2
PFA4Q12006 YGR130CYGR130C 2451 nt1.28□□□□□ -2.2
PFA4Q12006 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.28□□□□□ -2.2
PFA4Q12006 COX5BYIL111W 456 nt1.28□□□□□ -2.2
PFA4Q12006 CLU1YMR012W 3834 nt1.27□□□□□ -2.21
PFA4Q12006 AZF1YOR113W 2745 nt1.27□□□□□ -2.21
PFA4Q12006 BFR2YDR299W 1605 nt1.27□□□□□ -2.21
PFA4Q12006 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.27□□□□□ -2.21
PFA4Q12006 PET127YOR017W 2403 nt1.27□□□□□ -2.21
PFA4Q12006 EST2YLR318W 2655 nt1.26□□□□□ -2.21
PFA4Q12006 FYV8YGR196C 2454 nt1.26□□□□□ -2.21
PFA4Q12006 YLL020CYLL020C 306 nt1.26□□□□□ -2.21
PFA4Q12006 YLR282CYLR282C 342 nt1.26□□□□□ -2.21
PFA4Q12006 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt1.26□□□□□ -2.21
PFA4Q12006 snR48snR48 113 nt1.26□□□□□ -2.21
PFA4Q12006 PIK1YNL267W 3201 nt1.26□□□□□ -2.21
PFA4Q12006 HKR1YDR420W 5409 nt1.26□□□□□ -2.21
PFA4Q12006 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt1.25□□□□□ -2.21
PFA4Q12006 PMD1YER132C 5262 nt1.25□□□□□ -2.21
PFA4Q12006 TRM732YMR259C 4263 nt1.24□□□□□ -2.21
PFA4Q12006 YML002WYML002W 2214 nt1.24□□□□□ -2.21
PFA4Q12006 RPL26BYGR034W 384 nt1.24□□□□□ -2.21
PFA4Q12006 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.24□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.5 ms