Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms