Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMOD3Q0VAK6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms