Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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SYCNQ0VAF6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYCNQ0VAF6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
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