Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM27E3Q08E93 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms