Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPOCK1Q08629 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPOCK1Q08629 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPOCK1Q08629 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPOCK1Q08629 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPOCK1Q08629 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPOCK1Q08629 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPOCK1Q08629 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPOCK1Q08629 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPOCK1Q08629 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPOCK1Q08629 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPOCK1Q08629 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPOCK1Q08629 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPOCK1Q08629 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPOCK1Q08629 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPOCK1Q08629 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPOCK1Q08629 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPOCK1Q08629 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPOCK1Q08629 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCK1Q08629 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCK1Q08629 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCK1Q08629 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCK1Q08629 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCK1Q08629 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCK1Q08629 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCK1Q08629 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCK1Q08629 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCK1Q08629 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCK1Q08629 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCK1Q08629 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCK1Q08629 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCK1Q08629 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCK1Q08629 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCK1Q08629 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCK1Q08629 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCK1Q08629 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCK1Q08629 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCK1Q08629 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCK1Q08629 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCK1Q08629 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCK1Q08629 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCK1Q08629 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCK1Q08629 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCK1Q08629 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCK1Q08629 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPOCK1Q08629 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPOCK1Q08629 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPOCK1Q08629 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms