Protein–RNA interactions for Protein: Q08490

SGO1, Shugoshin, yeastyeast

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Length 590 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SGO1Q08490 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt1.88□□□□□ -2.11
SGO1Q08490 NUP192YJL039C 5052 nt1.88□□□□□ -2.11
SGO1Q08490 COG4YPR105C 2586 nt1.88□□□□□ -2.11
SGO1Q08490 YLR419WYLR419W 4308 nt1.87□□□□□ -2.11
SGO1Q08490 YER053C-AYER053C-A 114 nt1.87□□□□□ -2.11
SGO1Q08490 YJL022WYJL022W 309 nt1.87□□□□□ -2.11
SGO1Q08490 COX12YLR038C 252 nt1.87□□□□□ -2.11
SGO1Q08490 YJR039WYJR039W 3366 nt1.86□□□□□ -2.11
SGO1Q08490 FRK1YPL141C 2598 nt1.86□□□□□ -2.11
SGO1Q08490 STF2YGR008C 255 nt1.86□□□□□ -2.11
SGO1Q08490 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt1.86□□□□□ -2.11
SGO1Q08490 YBL109WYBL109W 336 nt1.86□□□□□ -2.11
SGO1Q08490 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt1.86□□□□□ -2.11
SGO1Q08490 UTP21YLR409C 2820 nt1.86□□□□□ -2.11
SGO1Q08490 YOR093CYOR093C 4947 nt1.86□□□□□ -2.11
SGO1Q08490 FAB1YFR019W 6837 nt1.86□□□□□ -2.11
SGO1Q08490 PAA1YDR071C 576 nt1.85□□□□□ -2.11
SGO1Q08490 SLI15YBR156C 2097 nt1.85□□□□□ -2.11
SGO1Q08490 ALY2YJL084C 3141 nt1.84□□□□□ -2.11
SGO1Q08490 CDC31YOR257W 486 nt1.83□□□□□ -2.12
SGO1Q08490 SKI3YPR189W 4299 nt1.82□□□□□ -2.12
SGO1Q08490 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.82□□□□□ -2.12
SGO1Q08490 EMC5YIL027C 426 nt1.82□□□□□ -2.12
SGO1Q08490 TMA7YLR262C-A 195 nt1.82□□□□□ -2.12
SGO1Q08490 SPO24YPR036W-A 204 nt1.82□□□□□ -2.12
SGO1Q08490 DNF3YMR162C 4971 nt1.81□□□□□ -2.12
SGO1Q08490 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt1.81□□□□□ -2.12
SGO1Q08490 ADR1YDR216W 3972 nt1.81□□□□□ -2.12
SGO1Q08490 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt1.8□□□□□ -2.12
SGO1Q08490 RTP1YMR185W 2946 nt1.79□□□□□ -2.12
SGO1Q08490 TTI1YKL033W 3117 nt1.79□□□□□ -2.12
SGO1Q08490 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt1.79□□□□□ -2.12
SGO1Q08490 COA6YMR244C-A 315 nt1.78□□□□□ -2.12
SGO1Q08490 POL5YEL055C 3069 nt1.77□□□□□ -2.13
SGO1Q08490 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt1.77□□□□□ -2.13
SGO1Q08490 APL1YJR005W 2103 nt1.77□□□□□ -2.13
SGO1Q08490 PAN2YGL094C 3348 nt1.77□□□□□ -2.13
SGO1Q08490 PRP5YBR237W 2550 nt1.76□□□□□ -2.13
SGO1Q08490 PKH3YDR466W 2697 nt1.76□□□□□ -2.13
SGO1Q08490 YLL054CYLL054C 2532 nt1.76□□□□□ -2.13
SGO1Q08490 VPS15YBR097W 4365 nt1.75□□□□□ -2.13
SGO1Q08490 YOR019WYOR019W 2193 nt1.75□□□□□ -2.13
SGO1Q08490 YLR422WYLR422W 5799 nt1.74□□□□□ -2.13
SGO1Q08490 LHS1YKL073W 2646 nt1.74□□□□□ -2.13
SGO1Q08490 YDL206WYDL206W 2289 nt1.74□□□□□ -2.13
SGO1Q08490 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.74□□□□□ -2.13
SGO1Q08490 YNL211CYNL211C 261 nt1.74□□□□□ -2.13
SGO1Q08490 FIG2YCR089W 4830 nt1.74□□□□□ -2.13
SGO1Q08490 UFD2YDL190C 2886 nt1.74□□□□□ -2.13
SGO1Q08490 CFT1YDR301W 4074 nt1.74□□□□□ -2.13
SGO1Q08490 KAP122YGL016W 3246 nt1.74□□□□□ -2.13
SGO1Q08490 TFB5YDR079C-A 219 nt1.72□□□□□ -2.13
SGO1Q08490 NUP157YER105C 4176 nt1.72□□□□□ -2.13
SGO1Q08490 RAD50YNL250W 3939 nt1.72□□□□□ -2.13
SGO1Q08490 YDR544CYDR544C 429 nt1.71□□□□□ -2.14
SGO1Q08490 PMP2YEL017C-A 132 nt1.71□□□□□ -2.14
SGO1Q08490 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt1.71□□□□□ -2.14
SGO1Q08490 YBR099CYBR099C 384 nt1.71□□□□□ -2.14
SGO1Q08490 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt1.7□□□□□ -2.14
SGO1Q08490 CMC4YMR194C-B 222 nt1.7□□□□□ -2.14
SGO1Q08490 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt1.7□□□□□ -2.14
SGO1Q08490 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt1.68□□□□□ -2.14
SGO1Q08490 TRM732YMR259C 4263 nt1.68□□□□□ -2.14
SGO1Q08490 SLX4YLR135W 2247 nt1.68□□□□□ -2.14
SGO1Q08490 SXM1YDR395W 2835 nt1.67□□□□□ -2.14
SGO1Q08490 YGL182CYGL182C 324 nt1.67□□□□□ -2.14
SGO1Q08490 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt1.67□□□□□ -2.14
SGO1Q08490 snR14snR14 160 nt1.67□□□□□ -2.14
SGO1Q08490 BRR2YER172C 6492 nt1.67□□□□□ -2.14
SGO1Q08490 MON2YNL297C 4911 nt1.67□□□□□ -2.14
SGO1Q08490 CHS6YJL099W 2241 nt1.67□□□□□ -2.14
SGO1Q08490 MMS4YBR098W 2076 nt1.67□□□□□ -2.14
SGO1Q08490 CHS1YNL192W 3396 nt1.66□□□□□ -2.14
SGO1Q08490 SMC4YLR086W 4257 nt1.66□□□□□ -2.14
SGO1Q08490 OST4YDL232W 111 nt1.66□□□□□ -2.14
SGO1Q08490 YMR326CYMR326C 309 nt1.66□□□□□ -2.14
SGO1Q08490 IRA1YBR140C 9279 nt1.65□□□□□ -2.15
SGO1Q08490 CAT8YMR280C 4302 nt1.64□□□□□ -2.15
SGO1Q08490 SSK2YNR031C 4740 nt1.64□□□□□ -2.15
SGO1Q08490 BFR2YDR299W 1605 nt1.64□□□□□ -2.15
SGO1Q08490 STB6YKL072W 2301 nt1.64□□□□□ -2.15
SGO1Q08490 UTP8YGR128C 2142 nt1.63□□□□□ -2.15
SGO1Q08490 CCH1YGR217W 6120 nt1.63□□□□□ -2.15
SGO1Q08490 YAR009CYAR009C 3591 nt1.63□□□□□ -2.15
SGO1Q08490 SPC110YDR356W 2835 nt1.62□□□□□ -2.15
SGO1Q08490 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt1.62□□□□□ -2.15
SGO1Q08490 RSM22YKL155C 1887 nt1.62□□□□□ -2.15
SGO1Q08490 YGR130CYGR130C 2451 nt1.62□□□□□ -2.15
SGO1Q08490 SOM1YEL059C-A 225 nt1.61□□□□□ -2.15
SGO1Q08490 YLR282CYLR282C 342 nt1.61□□□□□ -2.15
SGO1Q08490 YLL020CYLL020C 306 nt1.6□□□□□ -2.15
SGO1Q08490 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt1.6□□□□□ -2.15
SGO1Q08490 EAF1YDR359C 2949 nt1.6□□□□□ -2.15
SGO1Q08490 QCR9YGR183C 201 nt1.59□□□□□ -2.15
SGO1Q08490 YHR217CYHR217C 462 nt1.59□□□□□ -2.15
SGO1Q08490 SWI4YER111C 3282 nt1.59□□□□□ -2.16
SGO1Q08490 MSH3YCR092C 3057 nt1.59□□□□□ -2.16
SGO1Q08490 ROM2YLR371W 4071 nt1.59□□□□□ -2.16
SGO1Q08490 SMC1YFL008W 3678 nt1.58□□□□□ -2.16
SGO1Q08490 SET3YKR029C 2256 nt1.58□□□□□ -2.16
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